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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录

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    [LV.7]常住居民III

    自我介绍
    数学中国浅夏
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    1#
    发表于 2021-11-24 16:50 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
                                                                【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录
    , U" C6 H% n) M: ?4 a书籍:《R语言与数据挖掘》3 W7 r" N  Q, t3 l+ L3 k8 V
    #(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat+ m4 N% V7 J1 M; p; |1 r, q: |; }
    library(reshape)' v4 \0 C( E6 B; X' C- |) b
    CO2
      s7 g, d9 C2 cCO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))
    ! q& L" z3 Z* R, s4 g) {& P3 D4 R7 j+ B5 n# j7 |% _5 t
    #(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行. f. R- H7 P1 y  f: n
    > anyNA(CO2)# R/ Y0 Y, C3 [5 P( [5 t7 B
    [1] FALSE
    ' U% n' O2 |% T. q/ |% e* I, v#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]$ k7 X, I. r9 q4 r. ]% ^6 {$ v

    + ?- W2 H( G, j3 l% k; [#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)
    6 j# k- X! B1 W#篇幅问题删除部分输出数据: p5 i8 x5 j% O& U! c5 E
    > sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小2 u  N; b8 I: H! H8 @, T
    [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
    4 {  z6 e) G$ z" ~5 m; o3 ][13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4
    1 G$ T$ e5 `: a[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
    7 v, e: @# \; s" z* U# n4 S% v5 P[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2
    $ Y/ I% ^* i* E9 M$ \# X6 L[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9
    & i. \- E5 g9 n# c) C> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)
    ) ]% J2 Z% N' M$ I! e& Y [1]  7.7  9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6
    & v# M& L: Y0 T2 `3 h* b[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1
    " b' g" z( o8 L3 A# L$ \9 `' D[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8
    " {( ^2 [& a  r! A' t: U' E[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9
    4 K6 e) C: E& j$ K  p$ B8 l; y0 U) ?! L[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3! a2 t- b0 B% r! U# t/ v7 ]: h

    # ^' E: F& W7 e/ r( P5 r> CO2[order(CO2$uptake),]
    % N2 k8 b4 c7 u( a: @0 f0 R% z   Plant        Type      Treat conc uptake
    7 A- R; |' M3 K71   Mc2 Mississippi    chilled   95    7.72 R( `9 O* j" K( `1 A2 r
    29   Qc2      Quebec    chilled   95    9.3
      Q& U; b" L7 V% }" n64   Mc1 Mississippi    chilled   95   10.5
    $ m, i9 ~$ T. c- n3 f& V43   Mn1 Mississippi nonchilled   95   10.6
    , x- G/ q2 M3 i4 v5 ]2 L/ ~78   Mc3 Mississippi    chilled   95   10.62 m4 t7 e; k& v! |$ `
    57   Mn3 Mississippi nonchilled   95   11.3
    - n2 a/ R8 O2 ~* x5 ^5 r/ W+ v0 t
    7 L6 O0 Q  i( D% o> CO2[order(-CO2$uptake),]( \, _3 e) V8 P6 m
       Plant        Type      Treat conc uptake
    + Y0 f& |" f  Z1 t1 N21   Qn3      Quebec nonchilled 1000   45.5
    : R6 L3 z# }, K14   Qn2      Quebec nonchilled 1000   44.3* r) z/ |% G5 j" _- W/ Y
    20   Qn3      Quebec nonchilled  675   43.9! t3 P3 }# B3 i8 }0 T, X& b
    19   Qn3      Quebec nonchilled  500   42.9
    ; ^& \  A5 d$ C* H" G+ u35   Qc2      Quebec    chilled 1000   42.4
    , A# ~; h1 g2 V8 r  f5 a) G! F! k5 o7 I2 L6 i
    #(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4& C3 D8 [2 y/ Y
    n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))( q* a4 a1 l8 A2 \$ f
    (sample1 <- CO2[n == 1,])9 X) `. b* ]0 D  n1 ?, ]8 p5 w
    (sample2 <- CO2[n == 2,])) S; P7 w) ^# g0 i! R( q

    ' `9 S# t1 z8 q/ [1 h2 \#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值
    ' E5 }4 c& A5 P* V/ \3 c+ i" ~# itapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)
    , R$ m: F" j6 @6 I9 k0 j1 i+ x, q2 s
    * w% _/ F8 k" ~. R* l9 B- ]2 m#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值
    " `4 ^. S2 G5 }5 o- kaggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)) X# }9 W2 n6 s# I  N2 y
    8 \( G. ^# o2 D
    #(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值
    5 W8 I+ W' H8 Olapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)7 T: C1 r$ z- V
    8 p* E% A: J& U# g
    #(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中% ~/ w6 V0 x! Q* c! b
    Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)
    - @  M1 {8 T  G. a/ w8 f" F# S+ IPlant_Qn
    . Z1 l2 C# {8 f$ t7 @, r4 L& e
    : r0 _( F. h$ D$ C$ ^#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“$ u: Q5 w1 T, D

    . B8 {3 S0 A# {* c. E- C; k" @' M* @5 y1 c% Y+ k: F2 ^
    #编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度+ S- A7 p& I0 M) X; i+ o4 I0 y0 `
    #生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……9 _, \2 z+ ?  C0 r# J
    gsub("[t]","t",CO2$Plant)! M1 E/ j1 l) y" \7 W
    * s/ y3 M, v& W: g% t; h
    library(fBasics)
    2 ~9 Z2 Y( }7 u% Istat <- function(x)$ W- `) M( X; W) C. ^1 V
    {+ C/ U& F9 W- u; `+ V: A
      if(!is.numeric(x))
    " f% {! c* ?2 T9 \0 e  {
    9 |* C  m0 u$ p5 y. Y3 T5 J    stop("the input data must be numeric!\n")
    # H+ c6 j1 |% \* {  }
    ( h2 C- I% k6 a0 a2 G2 u  if(length(x) == 1)
    . f' W- F# g5 [; [0 \4 j  {
    9 |$ E. z; G  S3 E    stop("can not compute sd for one number!\n")& }* F# m6 m2 E  d+ d
      }, V6 t" L  u* o. }4 Q
      max1 <- max(x), R/ L* E4 ]+ L2 Q
      min1 <- min(x)4 R  @; a/ \( a2 ~- Y
      mean1 <- mean(x)
    7 J% p9 h3 o0 o  u8 ]  h& Y# X7 Z: Z' k  skewness1 <- skewness(x)! D1 v+ R. d, e
      kurtosis1 <- kurtosis(x)1 r$ U& U% O- D
      answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)- c; J* Y5 G8 i" I% ?
      return(answer)
    . X, }& D2 n( i" N: x6 h3 h, D}
    4 L& ?# U8 I$ @3 n& z. z/ B' q) k9 ~* X$ c9 L* V
    t <- rt(100,2)
    ( Y7 a  v) E9 a: |: w3 |  gstat(t)
    ' v+ \7 h' G# a9 X3 M0 ~8 g9 v3 H4 v) `5 {/ @, i0 K
    : x9 p5 X' H9 X6 @; ^7 ~
    + O- }. a$ Y* S( Q  Z/ c5 r, w0 f  B6 |
    3 S8 C% L6 }/ Q# e
    zan
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